Stian Michalsen skrev sin første fotballkontrakt med Viking foran 2016-sesongen, hans tredje og siste som junior.

Michalsen ble tatt ut i sin første landslagstropp på G15 i 2012. I 2015 ble han kalt inn på G18-landslaget. Men det året var også karakterisert av skader. Likevel fikk gutten fra Tasta med seg en A-kamp mot Start inne på Stadion rett før sesongen startet, et avgjørende frispark-mål i kvartfinalen i NM for juniorer, landslagsuttak og en sterk innsats også i cupens semifinale.

- Stian er en spennende spiller som kan utfordre alt og alle. Han har stort finterepertoar og er hurtig, sier rekrutt-trener Thomas Pereira. 

Michalsen opererer oftest ute på kanten. I 3. divisjon spilte han ni kamper og scoret sju mål i 2015. 

I mars 2016 ble Michalsen lånt ut for til 2. divisjonsklubben Sola for første halvdel av fotballsesongen. I juli kom han tilbake, og spilte så i treningskampene mot Hinna og Arsenal.

Søndag 2. oktober 2016 fikk Michaelsen seriedebuten da han kom på som innbytter i 2-0 seieren over Start på Viking Stadion.